– моментальные уведомления о рынке акций
– моментальные уведомления о рынке акций
Conducting entirely virtual screens of multi-billion molecule virtual libraries, Deep Apple can quickly identify hits that promote specific signaling in GPCRs and other target classes
San Francisco-based company created by ATP with academic co-founders Georgios Skiniotis, Brian Shoichet, and John Irwin is discovering novel small molecules in a vastly expanded virtual chemical space, to tackle a wide range of diseases
Deep Apple emerges from stealth with a Series A commitment of $52 million from ATP
SAN FRANCISCO and NEW YORK, Dec. 14, 2023 /PRNewswire/ -- Apple Tree Partners (ATP), a leader in life sciences venture capital, today announced $52 million in Series A funding for its portfolio company Deep Apple Therapeutics, created and incubated by ATP to rapidly discover novel small molecule therapeutics for high-value targets through virtual screening of AI-generated virtual libraries. With a powerful discovery engine that combines ensemble cryo-EM, deep learning, and molecular docking screens of ultra-large libraries, Deep Apple can go from target identification to lead optimization in less than 12 months – a fraction of the industry standard time – and can pursue biological target signaling inaccessible to conventional discovery approaches. Deep Apple's discovery engine is broadly applicable across disease areas and is particularly well-suited to expedited hit-finding against integral membrane proteins. The company currently is advancing multiple programs focused on GPCR modulators, a proven target class with applications in metabolic disorders, inflammation, immunology, and endocrine diseases.
Deep Apple's drug discovery engine builds upon leading expertise and technologies from its academic co-founders: Georgios Skiniotis, Ph.D., of Stanford University, a world leader in cryo-EM and GPCR structural biology; Brian Shoichet, Ph.D., of the University of California San Francisco (UCSF), a pioneer of virtual screening; and John Irwin, Ph.D., of UCSF, the computational library authority who created the widely used ZINC free virtual library of more than 10 billion synthesizable compounds.
"ATP created Deep Apple to revolutionize drug discovery in terms of speed, cost, and effectiveness," said Spiros Liras, Ph.D., founding CEO of Deep Apple and a Venture Partner at ATP. "We brought together unique capabilities from our founders to build a true deep learning discovery engine that stands apart from the pack of AI-driven approaches to protein structure elucidation and drug discovery. Machine-learning enabled processing of cryo-EM data allows us to reveal biologically relevant conformations in the context of interactions with signaling partners – transient binding pockets that may be missed by static models and empirical screening methods. And our virtual large-scale docking enables us to quickly home in on the right drug for the right target."
Deep Apple conducts in silico screening of billions of synthesizable compounds against orthosteric and allosteric binding sites in mere hours, and then computationally generates vast project-specific virtual libraries to discover proprietary chemotypes with desirable dockable and druggable properties. Wet-lab interrogations of the chosen virtual compounds feed back into the company's deep learning models to continually improve predictive performance.
"Deep Apple exclusively uses virtual screening for hit identification, and we have achieved high-quality hits against difficult-to-drug targets at an extremely fast pace," said Paul Da Silva Jardine, Ph.D., Chief Scientific Officer at Deep Apple and a Venture Partner at ATP. "Since we commenced operations last year, we have initiated multiple GPCR programs, including non-peptide/non-GLP-1 programs in obesity and weight management, as well as promising programs in inflammation and inflammatory disorders. And with the versatility of our discovery platform, GPCRs are only the tip of the iceberg."
"ATP founds and builds companies that bring together critical technologies and efficient research plans for translation," said Seth Harrison, M.D., ATP Founder and Managing Partner. "In my more than three decades of investing in biotech startups, particularly in early-stage drug discovery platform technology, I have never seen a company to move as rapidly as Deep Apple has, from chemical biological idea to development candidate, for high-value, difficult-to-address targets."
About Deep Apple Therapeutics
In a vast, unexplored virtual chemical space, Deep Apple Therapeutics moves with unprecedented speed to discover novel small molecules for high-value targets. Deep Apple combines ensemble cryo-EM to explore receptor conformations; deep learning; and the docking of multi-billion compound libraries generated using the company's proprietary Orchard.ai™ algorithm. Deep Apple's deep learning discovery engine is built upon founder expertise in computational modeling, protein and target structure determination, large-scale molecular docking, and the elucidation of protein dynamics and conformational transitions. This structure-based, machine-learning driven drug design approach enables the company to rapidly advance novel candidates addressing well-validated targets in inflammatory, metabolic, and endocrine diseases. For more information, visit deepappletx.com.
About Apple Tree Partners
Apple Tree Partners (ATP) is a leader in life sciences venture capital, with a 25-year track record of translating emerging scientific advances into novel innovative treatments. ATP creates companies starting at various stages, from pre-IP ideas to asset spinouts, investing in them from seed stage through IPO and beyond. The core of ATP's strategy is providing flexible capital and access to a world-class team of venture partners and EIRs, to build sustainable, research-driven enterprises that deliver therapeutics to improve human lives. For more information, visit www.appletreepartners.com.
SOURCE Deep Apple
Проводя полностью виртуальные проверки многомиллиардных молекулярных виртуальных библиотек, Deep Apple может быстро идентифицировать попадания, которые способствуют специфической передаче сигналов в GPCR и других целевых классах
Базирующаяся в Сан-Франциско компания, созданная ATP совместно с академическими соучредителями Георгиосом Скиниотисом, Брайаном Шойше и Джоном Ирвином, открывает новые малые молекулы в значительно расширенном виртуальном химическом пространстве для борьбы с широким спектром заболеваний
Deep Apple выходит из stealth с обязательством ATP на серию A в размере 52 миллионов долларов
САН-ФРАНЦИСКО и НЬЮ-ЙОРК, 14 декабря 2023 г. /PRNewswire/ -- Apple Tree Partners (ATP), лидер в области венчурного капитала в области наук о жизни, сегодня объявила о финансировании серии А в размере 52 миллионов долларов для своей портфельной компании Deep Apple Therapeutics, созданной и инкубируемой ATP для быстрого открытия новых низкомолекулярных терапевтических средств для высокоценные цели с помощью виртуального скрининга виртуальных библиотек, созданных с помощью искусственного интеллекта. Благодаря мощному механизму обнаружения, который сочетает в себе комплексную криоэмиссию, глубокое обучение и молекулярные док-экраны сверхбольших библиотек, Deep Apple может перейти от идентификации цели к оптимизации лидов менее чем за 12 месяцев - это доля стандартного времени в отрасли – и может использовать биологическую сигнализацию о мишенях, недоступную для обычных подходов к обнаружению. Механизм обнаружения Deep Apple широко применим в различных областях, связанных с заболеваниями, и особенно хорошо подходит для ускоренного поиска антител к интегральным мембранным белкам. В настоящее время компания продвигает несколько программ, ориентированных на модуляторы GPCR, проверенный целевой класс, который применяется при нарушениях обмена веществ, воспалении, иммунологии и эндокринных заболеваниях.
Механизм поиска лекарств Deep Apple основан на передовом опыте и технологиях ее академических соучредителей: Георгиоса Скиниотиса, доктора философии Стэнфордского университета, мирового лидера в области крио-ЭМ и GPCR структурной биологии; Брайана Шойше, доктора философии Калифорнийского университета в Сан-Франциско (UCSF), пионера из virtual screening; и Джон Ирвин, доктор философии из UCSF, управления вычислительной библиотеки, который создал широко используемую виртуальную библиотеку без цинка, содержащую более 10 миллиардов синтезируемых соединений.
"ATP создала Deep Apple, чтобы произвести революцию в разработке лекарств с точки зрения скорости, стоимости и эффективности", - сказал Спирос Лирас, доктор философии, генеральный директор-основатель Deep Apple и венчурный партнер ATP. "Мы объединили уникальные возможности наших основателей, чтобы создать настоящий механизм обнаружения с помощью глубокого обучения, который стоит особняком от множества подходов, основанных на искусственном интеллекте, к выяснению структуры белков и открытию лекарств. Обработка данных криоэм с использованием машинного обучения позволяет нам выявлять биологически значимые конформации в контексте взаимодействий с сигнальными партнерами - временные зоны связывания, которые могут быть пропущены статическими моделями и эмпирическими методами скрининга. А наша виртуальная крупномасштабная стыковка позволяет нам быстро подобрать нужный препарат для нужной цели".
Компания Deep Apple проводит in silico скрининг миллиардов синтезируемых соединений на наличие ортостерических и аллостерических сайтов связывания всего за несколько часов, а затем с помощью вычислений генерирует обширные виртуальные библиотеки для конкретных проектов, чтобы обнаружить запатентованные хемотипы с желаемыми закрепляемыми и лекарственными свойствами. Результаты лабораторных опросов выбранных виртуальных соединений используются в моделях глубокого обучения компании для постоянного повышения эффективности прогнозирования.
"Deep Apple использует исключительно виртуальный скрининг для идентификации поражений, и мы добились высококачественных результатов по мишеням, которые трудно поддаются лечению, чрезвычайно быстрыми темпами", - сказал Пол Да Силва Джардин, доктор философии, главный научный сотрудник Deep Apple и венчурный партнер ATP. "С тех пор как мы начали свою деятельность в прошлом году, мы инициировали множество программ GPCR, включая непептидные/не-GLP-1 программы при ожирении и контроле веса, а также многообещающие программы при воспалении и воспалительных расстройствах. А благодаря универсальности нашей платформы discovery, GPCR - это только верхушка айсберга".
"ATP основывает и строит компании, которые объединяют критически важные технологии и эффективные исследовательские планы в области перевода", - сказал Сет Харрисон, доктор медицины, основатель и управляющий партнер ATP. "За более чем три десятилетия инвестирования в биотехнологические стартапы, особенно в технологии платформ для разработки лекарств на ранних стадиях, я никогда не видел, чтобы компания двигалась так быстро, как Deep Apple, от химико-биологической идеи до кандидата на разработку, для достижения дорогостоящих, труднодостижимых целей".
О глубокой яблочной терапии
В обширном, неизведанном виртуальном химическом пространстве Deep Apple Therapeutics движется с беспрецедентной скоростью, открывая новые малые молекулы для высокоценных целей. Deep Apple объединяет ensemble cryo-EM для изучения конформаций рецепторов, глубокого обучения и стыковки многомиллиардных библиотек соединений, созданных с использованием запатентованного алгоритма компании Orchard.ai™. Механизм обнаружения глубокого обучения Deep от Apple основан на опыте основателя в области компьютерного моделирования, определения структуры белков и мишеней, крупномасштабного молекулярного докинга и выяснения динамики белков и конформационных переходов. Этот основанный на структуре подход к разработке лекарств, основанный на машинном обучении, позволяет компании быстро продвигать новых кандидатов, нацеленных на хорошо проверенные цели при воспалительных, метаболических и эндокринных заболеваниях. Для получения дополнительной информации посетите deepappletx.com.
О партнерах Apple Tree
Apple Tree Partners (ATP) - лидер в области венчурного капитала в области наук о жизни с 25-летним опытом воплощения новых научных достижений в новые инновационные методы лечения. ATP создает компании, начиная с различных стадий, от идей до IPO до выделения активов, инвестируя в них от начальной стадии до IPO и далее. Основой стратегии ATP является предоставление гибкого капитала и доступа к команде венчурных партнеров и EIR мирового класса для создания устойчивых, ориентированных на исследования предприятий, которые поставляют терапевтические препараты для улучшения жизни людей. Для получения дополнительной информации посетите www.appletreepartners.com.
ИСТОЧНИК Глубокое яблоко
Показать большеПоказать меньше
